药理学临床医学的论文提纲

论文题目：中药方剂龙虎白蛇汤的计算药理学研究

摘要：中药经过了数千年临床医学的积累,其已经是中华民族灿烂文化的一部分。中药现代化在中药的发展过程中有着重要的作用,其不仅能推动我国中药的快速发展,而且能推动整个现代医药产业的快速发展,并产生巨大的经济效益和社会效益。在中药现代化的进程中,中药的作用原理和中药的药效物质基础是中药现代化的核心问题。龙虎白蛇汤记载于《抗癌中药方选》,是一个抗癌复方,由龙葵、白英、白花蛇舌草、半支莲、黄药子、乌梅、无根藤等十一味中药组成。它是前人经过无数的实践总结出来的,在临床研究中对食管癌有较好的治疗效果,然而,目前对其药理学的研究还较少。因此,对于龙虎白蛇汤的药理学研究是一个重要的课题,并且从分子水平阐述其抗癌的作用机制也是现代药学研究的一个热点。本论文利用计算化学的方法对龙虎白蛇汤进行了药理学研究,主要包括以下三个部分:第一,查阅相关文献得到龙虎白蛇汤中的890种小分子化合物,在Cerius2软件中计算其化学描述符,并进行主成分分析。然后对182个治疗癌症的药物/类药分子进行化学描述符的计算与主成分分析。通过Lipinski五规则和两者的主成分分析研究,我们发现龙虎白蛇汤中所含的化学成分具有成药的药代动力学性质,并且可能含有治疗癌症的活性成分。第二,虚拟筛选,确定潜在活性成分。在Cerius2软件中,对每个靶点和龙虎白蛇汤中的小分子进行对接打分。以原配体和受体的对接得分为阈值,取龙虎白蛇汤中的小分子与相关靶标对接得分高于阈值的小分子。然后,筛选出得分较高的活性小分子,利用Pajek软件构建小分子-蛋白质网络图,并利用CintiBin软件计算Degree和Betweeness值,根据这两个参数值筛选出了16种可能潜在的活性抗癌成分,其中有10种分子已被报道具有抗炎、抗癌的生理活性。第三,精细对接。利用AutoDock软件对筛选出的16种小分子与部分靶标进行对接,通过分析分子与靶标的对接数据确定了龙虎白蛇汤的主要活性成分和分子作用机制,减少了后续药效物质基础研究的盲目性,为分子作用机制实验的研究和抗癌新药的研发提供了指导。

关键词：龙虎白蛇汤;虚拟筛选;癌症;计算药理学;分子对接

学科专业：物理化学

摘要

Abstract

第一章 综述

1.1 癌症概况

1.2 中药概况

1.3 中药发展面临问题与挑战

1.4 计算机辅助药物设计

1.4.1 概述

1.4.2 基本原理

1.4.3 理论计算方法

1.4.4 分类

1.5 论文研究内容及设计思路

第二章 方剂分析

2.1 中药方剂龙虎白蛇汤简介

2.2 龙虎白蛇汤的组分

2.2.1 白花蛇舌草

2.2.2 半支莲

2.2.3 龙葵

2.2.4 乌梅

2.2.5 黄药子

2.2.6 无根藤

2.2.7 白英

2.2.8 万毒虎

2.2.9 乌药

2.2.10 田三七

2.2.11 山绿豆

2.3 小结

第三章 化学空间分析

3.1 概述

3.2 分子描述符

3.3 分子描述符计算结果

3.4 讨论

3.5 主成分分析

第四章 中药方剂龙虎白蛇汤有效成分的虚拟筛选

4.1 选取抗癌靶标

4.2 方剂中所含分子与靶标蛋白的分子对接研究

4.3 构建小分子-靶标之间的网络图

4.4 结果与讨论

第五章 AutoDock对接

5.1 AutoDock对接步骤介绍

5.1.1 配体的筛选

5.1.2 受体的筛选

5.1.3 分子对接

5.2 结果与讨论

5.2.1 核苷二磷酸激酶（1F3F）

5.2.2 磷脂酰乙醇胺结合蛋白（2QYQ）

5.2.3 二氢叶酸还原酶（1MVT）

5.2.4 表皮生长因子受体（5EM8）

5.2.5 受体酪氨酸蛋白激酶Erbb-2（3BE1）

5.3 本章小结

第六章 结论

参考文献

附录A 中药方剂龙虎白蛇汤中各味中草药的化合物分子

致谢