乳链菌肽前体基因nisZ在乳酸乳球菌中的克隆和表达

2024-04-21

乳链菌肽前体基因nisZ在乳酸乳球菌中的克隆和表达(通用2篇)

篇1:乳链菌肽前体基因nisZ在乳酸乳球菌中的克隆和表达

乳链菌肽前体基因(nisZ)在乳酸乳球菌中的克隆和表达

用PCR技术从克隆有完整乳链菌肽生物合成基因簇(来自于乳链菌肽高产菌株L.LactisAL2)的重组噬菌体λHJ-3中扩增了编码乳链菌肽的前体基因,与pMG36e连接得到重组质粒pHJ201,用电击转化法将pHJ201转化到L.Lactis NZ9800中,经活性测定和Tricine-SDS-AGE电泳证实乳链菌肽前体基因获得了功能表达。DNA序列分析表明乳链菌肽高产菌株L.lactis AL2产生的`是NisinZ。发现pHJ201在L.lactis NZ9800中有良好的稳定性。

作 者:陈秀珠 胡海菁 杨巍 还连栋 作者单位:中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室,北京 100080刊 名:遗传学报 ISTIC SCI PKU英文刊名:ACTA GENETICA SINICA年,卷(期):28(3)分类号:Q933关键词:乳酸乳球菌 乳链菌肽前体基因 基因克隆 表达

篇2:乳链菌肽前体基因nisZ在乳酸乳球菌中的克隆和表达

关键词:九龙牦牛;葡萄糖转运蛋白;单羧酸转运蛋白;肌肉;低氧适应;基因表达

中图分类号:S823.8+52 文献标志码:A

文章编号:1002-1302(2014)08-0029-03

牦牛(Bos grunniens)是青藏高原特有的牛种,对高寒、低氧等恶劣生态环境有良好的适应性。低氧环境能导致细胞多种能量代谢通路的适应性变化,例如无氧酵解增加,单位葡萄糖产生的能量减少,进而导致细胞膜葡萄糖转运蛋白(GLUT)适应性增加。肌肉组织中最重要的GLUT家族成员包括GLUT1和GLUT4,其中GLUT4是肌肉和脂肪细胞中的主要葡萄糖转运蛋白[1],存在于细胞内,受胰岛素、运动和缺氧等因素影响[2-3]。肌肉是产生乳酸的主要组织,氧化型肌纤维(红肌)和心肌能以乳酸为燃料分子为机体提供能量[4]。在乳酸转运进入细胞的过程中,单羧酸转运蛋白(MCT)发挥重要作用。MCT有多个家族成员,其中,在肌肉中表达的主要有MCT1、MCT2和MCT4,在乳酸转运中发挥功能[5-6]。MCT1在氧化型纤维中表达水平高,被认为在乳酸向细胞内转运中发挥重要的作用[5]。Jurie等研究表明,低氧适应能使肌肉组织在能量代谢方面更依赖于葡萄糖[7]。因此,分析GLUT、MCT基因序列及其组织表达规律,对认识动物低氧适应的分子机制是重要的切入点。目前,关于暂时性缺氧对GLUT、MCT基因表达影响的研究已有不少,但对于低氧驯化的牦牛组织中GLUT、MCT还未见报道。因此,试验假设长期的低氧适应可能导致牦牛GLUT、MCT基因序列或组织表达水平发生改变,重点分析九龙牦牛GLUT4、MCT1和MCT4的基因序列及其在肌肉中的表达特点,并与普通牛比较,以探索牦牛适应低氧环境的分子机制。

1 材料与方法

1.1 试验动物及样品采集

试验所用九龙牦牛(Bos grunniens)样品采自四川省甘孜州九龙县,其中,0.5岁犊牛6头,3.5~5.5岁牦牛10头,7~10岁牦牛8头。屠宰时,迅速采集背最长肌和股四头肌,用锡箔纸包好,置于液氮内带回实验室,-80 ℃保存备用。另外,从四川省青白江市某屠宰场采集6头成年黄牛背最长肌和股四头肌样本作为对照。

1.2 试剂及器材

主要仪器包括高速冷冻离心机(日立)、超声波破碎仪(Sonics)、分光光度计(Cary 50,Varian)、电动匀浆器(PT-1200E,Kinematica)、凝胶成像系统(Gel Doc 2000,Bio-Rad)。荧光定量PCR试剂SYBR Premix Ex TaqTM(2×)购自TaKaRa公司;反转录试剂盒购自MBI公司;2×LongTaq Mix、Trizol试剂均购自天根公司。引物均由上海英骏生物技术有限公司合成。

1.3 牦牛GLUT4、MCT1和MCT4基因的克隆测序

取RNA 8 μL,用Random hexamer引物按Fermentas反转录试剂盒说明书进行反转录。根据GenBank中普通牛GLUT4、MCT1和MCT4基因mRNA序列(序列号依次为AY458600、BC104598和NM_001109980),用Primer premier 5.0软件设计引物。GLUT4-F:5′-CTAAGACAAGATGCCGTCG-3′,GLUT4-R:5′-TCAGTCATGCTCATCTGG C-3′;MCT1-F:5′-CGAGCCGCGTATAACGAT-3′;MCT1-R:5′-CCACAGGTTCAAACTGGACTCT-3′,MCT4-F:5′-CTTGGAACAGCCTCTGTCA-3′,MCT4-R:5′-GAGCGTTGACGGTCTCTG-3′。预期片段长度:GLUT4为1 540 bp,MCT1为 1 574 bp,MCT4为1 483 bp。PCR反应体系:2×Long Taq Mix 12.5 μL,灭菌水 8.5 μL,正、反引物各1 μL,cDNA 2 μL。PCR条件:94 ℃预变性5 min;94 ℃ 45 s,53 ℃(GLUT4)/55 ℃(MCT1)/56 ℃(MCT4)1 min,72 ℃ 2 min,共40個循环;72 ℃ 10 min。扩增产物用1 %琼脂糖凝胶电泳检测,然后经胶回收试剂盒纯化,按常规基因克隆技术进行克隆,每个基因的阳性克隆取3~5个菌液送上海英骏生物技术有限公司进行双向测序。

1.4 定量PCR分析牦牛肌肉中GLUT4、MCT1和MCT4 mRNA 水平

根据获得的九龙牦牛3个基因的cDNA序列,用Primer Premier 5.0软件跨内含子设计引物。GLUT4-F1:5′-TGGGGACACTCAATCAACT-3′;GLUT4-R1:5′-TCAGCCAACACCTCAGACA-3′,MCT1-F1:5′-AAACGCTGATGGACCTTG-3′;MCT1-R2:5′-TATGCCACATGCCCAGTA-3′;MCT4-F1:5′-GTCCACTGCCAGCAACTAC-3′,MCT4-R1:5′-AGCACCAGCACAAGGGA-3′。内参基因的引物根据GenBank中普通牛GAPDH序列(NM_001034034)设计,GAPDH-F:5′-CACCCTCAAGATTGTCAGC-3′,GAPDH-R:5′-TCATAAGTCCCTCCACGAT-3′。根据荧光定量PCR试剂盒说明配制20 μL的反应体系,其中,正、反向引物各0.5 μL,cDNA 1 μL。PCR条件:95 ℃ 30 s;95 ℃ 10 s,58 ℃(GLUT4、GAPDH)/62 ℃(MCT1、MCT4)10 s,72 ℃ 30 s,共45个循环。采用目的基因、内参基因的质粒作为标准品,制作标准曲线,目的基因的表达水平用内参基因校正。

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1.5 肌肉组织LDH总活力及其同工酶谱分析

准确称取0.2 g肌肉组织,加匀浆液(含10 mmol/L Tris、pH值为8.0,0.25 mol/L蔗糖,2 mmol/L EDTA)2.8 mL,用电动匀浆器在冰上匀浆30 s,取1 mL以转速10 000 g于4 ℃离心10 min,参照Marchat等方法[8]测定上清液LDH活力。酶活力的定义为:在25 ℃条件下,1 g新鲜组织1 min催化 1 μmol 底物转化为1个单位。LDH同工酶采用非变性的聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,酶活性染色[9]

2 结果与分析

2.1 牦牛GLUT4、MCT1和MCT4基因的克隆测序

采用RT-PCR方法扩增九龙牦牛背最长肌的GLUT4、MCT1和MCT4基因,均得到1条特异的扩增条带,并分别均与预期分子量大小相符(图略)。测序结果证实得到了GLUT4、MCT1和MCT4等3个基因的编码序列(CDS序列),并提交GenBank。

由表1可见,牦牛GLUT4基因(HM055486)CDS全长 1 530 bp,编码509个氨基酸,与普通牛相比有5个碱基差异和1个氨基酸差异,牦牛第293位为Val(缬氨酸),而普通牛为Met(甲硫氨酸),核苷酸和氨基酸相似性分别为99.67%和99.8%;牦牛MCT1基因(HM061149)CDS全长1 506 bp,编码501个氨基酸,与普通牛相比有6个碱基差异和2个氨基酸差异,牦牛第325位、354位分别为Iso(异亮氨酸)、Val(缬氨酸),而普通牛分别为Val、Iso,核苷酸和氨基酸相似性均为99.6%;牦牛MCT4基因(HM583655)CDS全长 1 386 bp,编码460个氨基酸,与普通牛相比有6个碱基差异,核苷酸相似性为99.56%,但氨基酸序列完全相同。牦牛3个基因与普通牛的碱基差异类型主要是转换。

2.2 牦牛肌肉GLUT4、MCT1、MCT4基因的发育谱

3个目的基因和内参基因的实时荧光定量PCR标准曲线扩增效率为94.5%~102.9%,符合分析要求。在牦牛背最长肌和股四头肌中,GLUT4、MCT1、MCT4 mRNA水平在各年龄段(0.5、3.5~5.5、7~10岁)均无显著差异。

2.3 牦牛与黄牛肌肉GLUT4、MCT1、MCT4基因表达比较

实时荧光定量PCR分析显示,成年九龙牦牛(n=10)与黄牛(n=8)背最长肌中,GLUT4、MCT4 mRNA水平无差别,MCT1 mRNA水平黄牛显著高于牦牛(P<0.05,图1);而在股四头肌中,GLUT4、MCT1、MCT4的mRNA水平均未见显著差异。

2.4 肌肉組织LDH活力和酶谱

试验结果表明,牦牛背最长肌中LDH总活力显著高于黄牛[牦牛(510±30) U/mg,黄牛(407±35) U/mg],而腿肌中LDH总活力接近[牦牛(305±31) U/mg,黄牛(282±47) U/mg]。由图2可见,牦牛背最长肌中LDH5的比例显著高于黄牛,而LDH2比例极显著低于黄牛。股四头肌中LDH同工酶比例无显著差异。

3 结论与讨论

酸序列及推导的氨基酸序列与普通牛相似性很高,均在99.5%以上,与其他很多功能基因研究结果[10-11]一致,这也说明牦牛与普通牛的亲缘关系很近。牦牛和普通牛存在氨基酸差异的有2个基因GlUT4和MCT1,存在差异的氨基酸性质相似(Val、Iso、Met),推测这些氨基酸的变化对相应载体蛋白功能影响很小,GlUT4、MCT1和MCT4基因序列具有保守性。

年龄增长的变化趋势,发现在骨骼肌中MCT1和MCT4 mRNA水平随年龄增加而发生不同程度的改变[12];Kirat等研究发现MCT1在成年牛肝脏的表达量极显著高于犊牛[13]。本试验结果与Hatta等研究结论存在差异,原因尚不清楚。

有关低氧刺激对GLUT、MCT基因表达影响的研究已有很多报道。Wood等研究发现,低氧能提高人的脂肪细胞GLUT1水平,但不会改变GLUT4水平[14]。Ullah等研究了体外培养的细胞(HeLa、COS、HL-1)中MCT1、 MCT2、MCT4对缺氧刺激的反应,结果表明,MCT4 mRNA和蛋白质表达水平均增加,MCT1和MCT2水平未见变化[15]。本研究中由于牦牛对低氧的长期驯化,相关能量代谢机制可能与暂时性缺氧有所不同。

MCT1在氧化型纤维中表达水平高,帮助乳酸向细胞内转运,参与乳酸的氧化利用[5]。McCullagh等研究了MCT1的表达,证实MCT1在红肌的表达与肌肉中乳酸吸收相关,与柠檬酸合成酶活性呈相关(肌肉氧化能力的标志),这说明MCT1能促进肌纤维细胞对乳酸的吸收,与LDH(心型)及氧化代谢相关酶协同表达[16]。由于LDH参与无氧酵解,而且LDH5倾向于将丙酮酸还原成乳酸[17]。九龙牦牛背最长肌中MCT1 mRNA表达量显著低于黄牛,背最长肌中LDH总活力、LDH5比例显著高于黄牛,这说明牦牛背最长肌糖代谢中乳酸的氧化低于黄牛,更倾向于无氧酵解,与牦牛生活环境中的氧含量是相适应的。然而,由于肌肉组织中可表达多种MCT[18],因此,牦牛和黄牛对乳酸的利用及其转运的分子基础比较,需要更加精细和全面的分析。

本试验结果初步表明,牦牛GLUT4、MCT1和MCT4基因序列与普通牛相似性高;与普通牛比较,牦牛背最长肌中较低的MCT1 mRNA水平与其较强的无氧代谢能力相吻合,可能是牦牛从分子水平上适应低氧环境的表现之一。

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