CVTree在454高通量测序分析菌群结构中的应用（精选5篇）
篇1：CVTree在454高通量测序分析菌群结构中的应用
1、在样品B中我加入了一株抗镉菌（属于假交替单胞菌），属于新发现菌种，目前尚无关于它的报道。我想问一下，如果我提供该菌的基因序列，是否可以再确定样品中是否含有该菌？若含有，是否可以定性定量的测量？
如果是确认有这个菌，而无报道的话，那么我们在公共数据库就比对不到相关信息；这个应该会归类到unclassifier里面；
我们测序的是16s基因的V3-V4可变区，如果您提供该菌株的16s基因序列给我们，我们可以帮忙找一下是否有测到这个序列，以及计算这个序列占总序列数的比例；
2、在表2.1 phylum水平上各样本主要rank reads数目（部分结果）中，样品A和B各自的比例加起来为什么不到100%？
这个是取小数点几位数造成的，这个总数应该极度接近100%；
3、在6_dif_analysis/
小代表什么？
P值是统计学的一个概念，可以简单的理解为，P值越小，差异越显著；Q值是对P值的一个矫正，基本可以不用理会；
4、我觉得这份报告对于一个对微生物不是很精通的人来说有点难懂，你们是否可以提供一份更加清晰易懂的报告（比如直接给出两个样品的比较结果）。我们提供的这份报告我个人认为已经很简单了，您现在难以完全理解，可能是对一些基本的概念还不是非常清楚，建议您多了解一些基本的概念，例如OTU等； 以上是我目前还存在的一些疑问，希望能从你们那里得到解答。期待你的尽快回复，非常感谢！物种丰度差异分析结果中，P值和Q值具体指什么？大
篇2：CVTree在454高通量测序分析菌群结构中的应用
一种基于荧光强度分析的高通量定量检测细胞凋亡方法
根据正常细胞、凋亡细胞和坏死细胞的细胞膜对核酸荧光染料的不同选择通透性,用4μmol/L YO-PRO-1(YP)和4μg/ml碘化丙啶(Propidium iodide,PI)染色96孔板中的.细胞样品.分别在485/538(Ex/Em,nm)和530/590(Ex/Em,nm)的检测波长下借助荧光分光光度计检测细胞样品孔的YP和PI荧光强度.将YP和PI荧光强度值与用荧光显微镜对同一细胞样品细胞凋亡和坏死的定量分析结果相对应,通过对YP荧光强度值与凋亡细胞数的直线回归分析(r=0.999,P＜0.01),得到依据YP荧光强度值求得凋亡细胞数的直线相关方程.该方法可检测出样品中少至180个的凋亡细胞,具有灵敏度高和快速高效的特点.
作 者：叶玲玲 刘红 刘兴茂 李世崇 吴本传 王启伟 陈昭烈 YE Ling-ling LIU Hong LIU Xing-mao LI Shi-chong WU Ben-chuan WANG Qi-wei CHEN Zhao-lie 作者单位：军事医学科学院生物工程研究所细胞工程室,北京,100071 刊 名：中国生物工程杂志 ISTIC PKU英文刊名：CHINA BIOTECHNOLOGY 年，卷(期)： 26(6) 分类号：Q819 关键词：荧光强度 高通量 定量检测 细胞凋亡篇3：CVTree在454高通量测序分析菌群结构中的应用
【摘 要】 目的：分析高通量透析器在血液透析患者中的应用效果。方法：选取90例长期血液透析患者，随机将其分为对照组和实验组各45例。对照组给予普通透析器治疗；实验组给予高通量透析器治疗。两组患者均给予碳酸氢盐透析，对比观察两组患者透析后肌酐（SCr）、尿素氨（BUN）、尿酸（UA）、血磷以及β2-微球蛋白（β2-M）的清除率。观察患者生命体征变化，评定透析效果。结果：透析后，两组患者的肌酐、尿素氨、尿酸的清除率差异无统计学意义（P>0.05）；血磷和β2-微球蛋白的清除方面，用高通量透析器的实验组效果明显优于对照组，具有统计学意义（P<0.05）；两组患者生命体征变化差异无统计学意义（P>0.05）。结论：高通量透析器能够有效清除血磷和β2-微球蛋白，且透析过程中生命体征变化波动小，安全性高，值得临床推广应用。
【关键词】 高通量透析器；血液透析；应用效果
【中图分类号】R459.5 【文献标志码】 A 【文章编号】1007-8517（2015）09-0073-02
血液透析（hemodialysis，HD）通过将体内血液引流至体外，经透析器，是通过弥散或者对流将血液与透析液间进行物质交换，从而清除体内的代谢废物、纠正电解质和酸碱失衡[1]，并将经过净化的血液回输到机体的整个过程。血液透析可以清除患者体内多余的水分，是治疗急慢性肾功能衰竭的方式之一[2]。血液透析效果好坏与透析器的使用相关。高通量透析器是超滤系数超过20 ml·h-1·mm Hg-1（1 mm Hg =0.133 kPa）的过滤器，它是根据透析膜通透性大小来界定的[3]。本文旨在研究高通量透析器在血液透析患者中的应用效果，现报告如下。
1 资料与方法
1.1 一般资料 选取我院2012年8月至2013年8月收治的90例长期血液透析患者，随机将其分为对照组和实验组。对照组45例，男25例，女20例；年龄43～74岁，平均年龄（59.8±5.6）岁；病程2～16年，平均病程（7.54±3.64）年；透析时间1～13年，平均透析时间（5.54±4.12）年。实验组45例，男19例，女26例；年龄44～72岁，平均年龄（57.8±4.6）岁；病程3～16年，平均病程（7.64±3.74）年；透析时间1～13年，平均透析时间（5.94±4.22）年。90例患者中12例慢性肾炎、26例高血压肾病、25例糖尿病肾病、14例慢性肾小球肾炎、5例多囊肾、8例痛风性肾病。两组患者在性别、年龄及病程等一般资料方面比较差异无统计学意义（P>0.05），具有可比性。
1.2 方法 对照组采用膜面积1.3m2，7.5ml/h·mmHg超滤系数的透析器，型号为Fresenius F6。实验组采用膜面积1.3m2，40ml/h·mmHg超滤系数的高通量透析器，型号为Fresenius F60。血液透析机均选用Fresenius 4008B，选择碳酸氢盐作为透析液，200～260ml/min的血流量，500Ml/min的透析液流量，透析4～5h/次，每周2～3次。密切观察患者透析过程中临床体征变化。两组均以3个月为1个疗程。
1.3 观察指标 对比观察两组患者透析一个疗程后肌酐（SCr）、尿素氨（BUN）、尿酸（UA）、血磷以及β2-微球蛋白（β2-M）的清除率。观察患者生命体征变化，包括收缩压、舒张压及心率等，评定透析效果。
1.4 数据处理 采用SPSS17.0统计学软件，计量资料采用t检验；计数资料使用χ2检验。P<0.05为差异具有统计学意义。
2 结果
透析后，两组患者的肌酐、尿素氨、尿酸的清除率差异不具有统计学意义（P>0.05）；血磷和β2-微球蛋白的清除方面，高通量透析器的实验组效果明显优于对照组差异具有统计学意义（P<0.05）。详见表1。
两组患者生命体征变化差异具有统计学意义（P>0.05），比较稳定。详见表2。
3 讨论
高通量透析器不仅对小分子毒素的清除率高，还能有效清除普通透析器难以清除的大分子毒素，帮助有效预防透析相关淀粉样变性、肾性骨病等并发症的发生[4]。本研究结果显示，肌酐、尿素氨、尿酸这类小分子毒素，普通透析器和高通量透析器的清除率相当；但对于血磷和β2-微球蛋白，高通量透析器清除率分别为（189.23±22.75） mmol/L和（71.21±17.32） mg/L，远远高于普通透析器。高通量透析器较大的血流量使其超滤系数也随之增大，从而影响患者血液动力学稳定。
透析时要注意内瘘穿刺针应该根据患者体质选择，有计划性的进行穿刺，选择合适的穿刺点，保护好内瘘以及穿刺部位[5]，保证血流量足够和高通量透析顺利进行，观察患者透析过程中是否出现胸闷、头昏、恶心、冷汗等现象。由于高通量透析会造成患者体内氨基酸等重要物质的流失，因此，为患者提供相应的营养支持是保证患者顺利接受透析的先决条件，医生应指导患者合理进食，补充高优质蛋白以及高维生素的摄入，禁食钾含量较高的食物，确保患者透析期间的营养供给正常。本研究实验表明，合理有效的高通量透析器在对患者进行血液透析时，可对血液中的大分子毒素进行有效清除，且患者生命体征与经普通透析器进行透析的患者无差异，表明高通量透析器效果安全可靠。
综上所述，高通量透析器在血液透析应用效果较好，可改善患者生命质量，值得临床推广使用。
参考文献
[1] 张伟明，钱家麒，陈楠，等.REXEEDTM系列高通量透析器疗效和安全性的临床随机对照试验[J].中华肾脏病杂志，2009，25（8）：601-606.
[2] 尹秀娟，邹林利，廖爱军，等.比较高通量透析器与普通透析器对血液透析患者腎素-血管紧张素II-醛固酮清除的关系[J].中国药物经济学，2013，（2）：155-157.
[3] Grooteman MP，Nube MJ，van Limbeek J，et al.Biocompatibility and performance of a modified cellulosic and a synthetic high flux dialyzer. A randomized crossover comparison between cellulose triacetate and polysulphon.[J].American Society for Artificial Internal Organs Journal，1995，41（2）：215-220.
[4] 金书慧.高通量透析器对血清β2微球蛋白和甲状旁腺激素清除效果的影响[J].医学信息（下旬刊），2011，24（10）：129.
[5] 黄红雨.高通量透析器在血液透析患者中的应用及护理[J].中外医疗，2012，31（14）：174，179.
篇4：CVTree在454高通量测序分析菌群结构中的应用
利用高效复合微生物菌群对生活垃圾和污泥混合堆肥,通过测定堆肥过程中总菌数、温度、有机物、C/N比等,较系统地研究了高效复合微生物菌群在生活垃圾、污泥混合堆肥系统中的作用.试验证明:在生活垃圾和污泥共堆肥系统中,调节堆料比为厨房垃圾:污泥:粉煤灰土:成熟堆肥污泥:干草=41.6:27.8:13.8:11.1:5.5,有机物约为60%,总氮14%,全磷0.69%,全钾1.25%;初始含水率为58.5%,初始C/N比=30i供气量控制在0.8L/min@kg挥发性有机物,处理1、处理2、处理3堆料中分别接种2%、3%、5%(质量分数)的高效复合微生物菌群,与加入3%灭活菌的对照组进行对比实验.对照组、处理1、处理2和处理3堆肥系统垃圾腐熟时间分别为30d、24d、18d和12d;说明高效复合微生物菌群可以加速生活垃圾和污泥的降解,保证堆肥过程的顺利进行.处理3与对照组相比,堆腐时间缩短了18d,同时成品堆肥中含有大量具有生物活性的.微生物,是一种良好的生物活性有机肥料.
作 者：席北斗 刘鸿亮 孟伟 李捍东 王庆生 作者单位：席北斗(清华大学环境科学与工程系,北京,100084)
刘鸿亮,孟伟,李捍东,王庆生(中国环境科学研究院,北京,100012)
篇5：我国中小企业融资对策研究
1. 缺少扶持中小企业发展的政策体系。
由于我国经济一直以国有经济为主导, 所以, 在我国, 大部分中小企业得不到金融机构的帮助。而且, 我国中小企业也很少能从银行获得政策性资金支持, 使得其在发展过程中遇到诸多困难。
2. 缺乏健全的担保体系。
当前, 我国中小企业要想从银行取得贷款就必须向银行申请抵押, 但是, 由于中小企业的规模较小, 无法提供抵押, 更找不到可以担保的机构, 所以, 大多是中小企业被迫选择“你贷款我担保, 我贷款你担保”形式。可是, 这种贷款形式存在很多缺陷, 即信用风险大, 贷款金额少, 不能满足中小企业的反战需求。面对这种现象, 政府要打破现状, 改变以往对中小企业扶持力度小、缺少贷款优惠政策的局面, 加强对中小企业的关注与扶持。
3. 信息不对称阻碍中小企业融资。
导致我国中小企业融资难的重要原因就是信息不透明, 因为银行等金融机构对我国中小企业的信用等级、我国中小企业的经营能力以及我国中小企业的盈利能力等信息掌握不清或是根本不理解, 所以对我国中小企业出怀疑态度, 二者无法达成共识, 当然就无法进行合作。
内在原因
1.经营管理不规范。我国中小企业处于融资难的境地, 与其自身存在的劣势和弊端脱离不了关系。在我国, 大多数中小企业规模小, 存在结构多变, 种类多, 信息不透明等弊端, 使得银行等金融机构对中小企业了解不多, 也使得自身很难得到银行的资金支持。
2.企业自身信用缺失。根据中国人民银行公布的报告不难看出, 我国大部分中小企业存在信任危机, 即银行等经融机构不信任中小企业。银行对中小企业的不信任不是凭空出现的, 这是由于以往的合作中, 中小企业存在很严重的债务拖欠问题, 甚至产生无法还清银行的款的现象, 严重影响了银行等金融机构对中小企业的信任。我国工商银行曾经对中小企业做了一次信用调查, 达到A信用等级的中小企业只有百分之十六点二, 而在B信用等级甚至其以下的中小企业达到了百分之八十三点八, 可见中小企业在银行等金融机构的信用之低。
3.中小企业自身经营风险很高。当下, 我国的中小企业大多数是竞争比较激烈的行业, 但是我国中小企业的一大特点, 或者也可以称之为劣势, 就是规模小, 科研水平低, 以至于造成极大的资源浪费。而且, 中小企业存在严重的管理问题, 在我国南方家族式企业居多, 情与理不能严格分开, 管理不专业。由于中小企业的资产规模、经营者素质等具有不确定性, 所以, 中小企业融资难可以说是必然现象。
二、解决我国中小企业融资困境的对策
1. 发展和完善金融机构体系。
在解决中小企业融资难这个问题上, 我国现在实行的投资、融资体系极少对中小企业提供支持和帮助。和西方发达国家不同的是, 国内中小企业的资金来源主要是银行贷款。可是, 在西方, 发达国家的中小企业可以顺利得到资金支持和相关的金融服务。比如, 西方发达国家有各种各样的专门为中小企业提供资金支持的金融机构和相当多的准金融机构, 为中小企业提供了间接的资金帮助;而且, 西方发达国家还有各种板块, 这为中小企业提供了极大的资金支持。
从近几年我国的各方面经济发展来看, 由于机构重组很多中小金融机构的数量不断递减。因此, 针对这种中小企业融资难的外部原因, 我国政府可以帮助建立和完善更多的中小金融机构体系, 而且, 还要积极促进中小企业同非国有金融机构的联系, 尽可能的加快对非国有金融机构开放国内市场, 加强对民间中小金融机构的扶持力度。
2. 优化法律环境。
任何企业的健康快速发展都离不开法律的保护, 我国中小企业也不例外。当中小企业得到法律制度的保护和支持后, 中小企业就可以在资金融合过程中得到契约权利。国家和政府需要不断完善相关法律法规, 肩负起规范中小企业融资主体的责任, 为中小企业融资提供更多的便利和保证, 制订各项相关的条款, 努力为我国中小企业提供一个可以公平竞争、可以健康发展的良好氛围。
简单地说, 就是中小企业要获得一个可以健康发展的环境, 法律法规是这个环境的重要保障, 如果, 没有了法律法规的支持, 我国中小企业就会遇到巨大发展难题。
3. 完善信用担保体系。
我国中小企业发展困难的重要原因就是缺乏资金, 发展过程中资金周转困难。而且, 中小企业没有大企业那样的经济实力, 达不到申请贷款时抵押的条件, 致使资金周转不灵, 严重影响中小企业未来的发展和生产规模的过大。因此, 完善中小企业融资的信用担保体系是对中小企业未来发展的极大支持。
所以, 要加快我国中小企业的发展进程, 就要向西方发达国家和城市学习, 借鉴他们的经验, 不仅要建立中小企业的信用担保体系, 还要不断完善和改进信用担保体系, 保证我国中小企业稳步发展, 扩大规模。
4. 规范自身经营管理。
发展和完善金融机构体系、优化法律环境、完善信用担保体系都是从客观上解决中小企业融资困难问题, 作为融资的主体, 我国中小企业必须要发挥主观能动性, 不断规范自身经营管理。当今, 大部分中小企业都实行“家长制”管理模式。这种管理模式, 不是先进的企业管理模式, 会阻碍企业发展, 不适合市场经济环境。
参考文献
[1]王婷婷, 孙志伟.对媒介融合下新闻实务类课程整合的研究[J].新闻界.2011 (08) .